在ODU使用超级计算机时,小组在菲律宾领导研讨会
2018年9月21日
在最近一次由bet8体育娱乐入口师生领导的研讨会上, 参加者学习使用大学的超级电脑进行基因分析, 这一切都发生在菲律宾.
为期两周的“组学和生物信息学”是一项4美元的计划的一部分.600万年, 由肯特·卡彭特(肯特·卡彭特)获得的五年国际RESEARCH与教育伙伴关系奖, 生物科学的教授和海洋生物学家.
2005年由美国国家科学基金会成立, PIRE的创建是为了支持国际RESEARCH和教育,并鼓励工人阶级的STEM劳动力.
卡彭特正在RESEARCH上个世纪人类对菲律宾鱼类遗传和物种多样性的影响.
他和Dan Barshis一起领导了这个工作坊, assistant professor of biological sciences; Dave Gauthier, associate professor of biological sciences; senior Ivan Lopez; and recent graduate Amanda Ackiss.
工作坊帮助你.S.美国的RESEARCH人员分享他们所知道的, 但是分析基因数据需要具有大内存的快速计算机. 这些在菲律宾这样的发展中国家很难得到.
在早期的研讨会上,讲师使用当地可用的计算机并进行调整.
通常在科学领域, 你可以修改数据,使之适合电脑,Wirawan Purwanto说, ODU信息技术服务领域的计算科学家. “但如果你使用一台大型计算机,机器可以处理真实的数据. 当查看缩减后的数据而不是实际大小时,情况可能会大不相同."
在最近的一次研讨会上,有30多名菲律宾RESEARCH生, RESEARCH助理, 教职员工和政府RESEARCH人员远程登录图灵, 位于校园的ODU超级计算机.
就像一个网页浏览器, 参与者的个人电脑充当屏幕,远离诺福克的处理器和服务器.
处理速度比台式电脑快8倍, 图灵提供高端, 快速数据分析与一个简单的登录. 学生可以看到和学到更多.
“除了一些软件上传之外,它真的是无缝的,”Purwanto说. “之前,他们不得不跳过一些步骤,修改数据,使其适用于他们拥有的计算机. 现在,学生们获得了处理基因数据的实际经验."
受益的不仅仅是学生. 根据Barshis的说法,图灵也改变了教师的体验.
“使用本地安装的系统不可能完成我们所有的分析, 所以从教学的角度来看,使用图灵是更可取的. 一切都很顺利,”他说.